Facultatea de Istorie şi Filosofie cuprinde 2 departamente - Istorie şi Filosofie - care înglobează 8 catedre: Catedra de Istorie Antică şi Arheologie, Catedra de Istorie Medievală şi Istoriografie, Catedra de Istorie Modernă, Catedra de Istorie Contemporană şi Relaţii Internaţionale, Catedra de Istoria Artei, Catedra de Filosfie sistematică, Catedra de Istoria Filosofiei şi Logică, Catedra de Istoria Filosofiei antice şi medievale. La acestea se adaugă mai multe centre de cercetare sau institute de cercetare autonome - Institutul de Pre- şi Protoistorie, Institutul de Studii Clasice, Centrul de Studii pentru Istoria şi Arheologia Dacică şi Romană, Institutul de Studii Central Europene (ISCE), Institutul de Istorie Orală, Institutul de Iudaistică şi Istorie Evreiască «Dr. Moshe Carmilly», Institutului de Studii Internaţionale, Centrul "Altiero Spinelli" de studiere a organizării europene (CASSOE), Seminarul de Antropologie Istorică, Semonarul de Demografie istorică, Institutul Italo-Român de Studii Istorice, Centrul de Studii Antice şi Medievale, Centrul de Cercetări aplicate în Fenomenologie (CECAF).
Facultatea de Istorie şi Filosofie are o misiune esenţială educaţională şi de cercetare, asigurată de un prestigios corp profesoral format din 86 profesori, conferenţiari, lectori şi asistenţi, pregătind specialişti în Istorie, Arheologie, Istoria artei, Arhivistică, Biblioteconomie şi ştiinţa informării, Studii iudaice, Etnologie, Relaţii internaţionale şi studii europene, Studii de securitate, Filosofie. In prezent, un număr de 1522 de studenţi urmează cursuri în cadrul Facultăţii de Istorie şi Filosofie, în limbile română, maghiară şi germană, la cele 10 specializări la nivel licenţă (3 ani) şi 15 specializări la nivel master (2 ani), şi în 2 domenii (Istorie şi Filosofie) la nivel doctorat.